Appendix I. Keep Learning
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⭐: 必读 ✨: 推荐
实践:
⭐《Bioinformatics Data Skills》by Vince Buffalo
理论:
⭐《Biological Sequence Analysis:Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids》 (English | 中文) by Richard Durbin, Sean R. Eddy, Anders Krogh, Graeme Mitchison
⭐《机器学习》 -- 周志华
✨Educational Papers by Nature Biotech. and PLOS Computational Biology (@evernote)
✨Statistics for biologist by Nature
edited based on Xiaofan Liu's list
数学基础 (建议根据自己的基础进行复习)
《高等数学》
《线性代数》
《数理统计与概率论》
入门书籍 (其中1、2可选一本精读,数学基础好的推荐选2)
《机器学习》,周志华著 (★★★★★推荐)
《统计学习方法》,李航著 (★★★★推荐)
《多元统计分析》,何晓群著
Python编程书籍
《Python机器学习基础教程》,[德]安德里亚斯·穆勒(Andreas C.Müller,[美]莎拉·吉多(Sarah Guido)著,张亮(hysic)译 (★★★★推荐)
《python高性能编程》,Micha,Gorelick,戈雷利克,Ian,Ozsvald ...著
深度学习类书籍 (希望加强对模型数学原理的理解,并且进一步学习深度学习的同学可选读)
《深度学习[deep learning]》,[美] Ian,Goodfellow,[加] Yoshua,Bengio,[加] Aaron ... 著(★★★★推荐)
《模式识别与机器学习(Pattern Recognition and Machine Learning)》,Christopher M. Bishop著
《机器学习:从概率的视角分析(The Machine Learning: A Probabilistic Perspective)》,Kevin P. Murphy著
注:PRML和MLAPP两本书难度较大
深度学习编程与实践书籍 (工具类书籍,不是必读) 1. 《Keras深度学习实战》,[意大利]安东尼奥·古利[印度]苏伊特·帕尔著,王海玲李昉译,于立国审 2. 《深度学习入门之PyTorch》,廖星宇著 3. 《深度学习框架PyTorch快速开发与实战》,邢梦来,王硕,孙洋洋著 4. 《TensorFlow实战》,黄文坚,唐源著
机器学习入门课程
浙江大学公开课:概率论与数理统计 (根据自己基础选择复习)
深度学习课程
Keras快速搭建神经网络 (★★★★推荐)